MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_5

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010659	T	7	7	93	99	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010659	TGT	2	6	109	114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010659	T	6	6	132	137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010659	G	6	6	167	172	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010659	AAAC	2	8	258	265	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010659	GTCG	2	8	320	327	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010659	GGAA	2	8	335	342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010659	AGC	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010659	CGG	2	6	1340	1345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010659	CGC	2	6	1404	1409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010659	AGCG	2	8	1428	1435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010659	TAG	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010659	TC	3	6	2049	2054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010659	TCG	2	6	2057	2062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010659	A	6	6	3706	3711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010659	GGT	2	6	3810	3815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010659	ACC	2	6	3826	3831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_010659	GTC	2	6	4832	4837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010659	A	6	6	4898	4903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010659	GAC	2	6	4905	4910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010659	AGGA	2	8	4916	4923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010659	CATA	2	8	5011	5018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.